Les méthylomes résolus par haplotype révèlent un déséquilibre de méthylation de l'ADN d'origine parentale dans le trouble du spectre autistiqueHaplotype-resolved methylomes reveal parent-of-origin DNA methylation imbalance in autism spectrum disorder.
- L'étude a utilisé le séquençage PacBio HiFi avec profilage de méthylation phasé par haplotype chez 124 individus de 31 quatuors TSA.
- Des différences de méthylation d'origine parentale ont été identifiées : 114 DMC paternelles et 106 maternelles, 45 et 46 DMR, et 2425 et 2695 MO respectivement.
- Ces altérations de méthylation sont enrichies dans des catégories de gènes pertinents pour le TSA, mais présentent des distributions génomiques et des voies fonctionnelles distinctes entre haplotypes parentaux.
L'article traite directement du TSA et de la méthylation de l'ADN d'origine parentale, avec des résultats robustes issus d'une technologie de pointe (PacBio HiFi) et publié dans une revue à fort impact (Science Advances). La pertinence clinique est élevée pour la compréhension des mécanismes épigénétiques du TSA.
La taille de l'échantillon (31 quatuors) reste modeste et pourrait limiter la généralisation des résultats. L'étude a été réalisée sur du sang périphérique, et la pertinence des profils de méthylation pour le tissu cérébral reste à établir. Les analyses sont basées sur des corrélations et nécessitent une validation fonctionnelle pour confirmer le rôle causal des altérations de méthylation.
Cette étude a analysé la méthylation de l'ADN d'origine parentale chez 124 individus (31 quatuors TSA) par séquençage PacBio HiFi phasé par haplotype. La comparaison entre les probants et leurs frères et sœurs non atteints a identifié des cytosines et régions différentiellement méthylées, ainsi que des valeurs aberrantes de méthylation, spécifiques aux haplotypes paternel et maternel. Ces altérations sont enrichies dans les gènes associés au TSA. De plus, des régions de méthylation allèle-spécifique (ASM) ont été détectées, dont 34 différentiellement exprimées et 62 aberrantes, avec un enrichissement notable dans le locus PWS/AS et les gènes du TSA. L'étude fournit des preuves d'un déséquilibre de méthylation dépendant de l'origine parentale dans la pathogenèse du TSA.
L'étude a utilisé le séquençage PacBio HiFi avec profilage de méthylation phasé par haplotype chez 124 individus de 31 quatuors TSA. Des différences de méthylation d'origine parentale ont été identifiées : 114 DMC paternelles et 106 maternelles, 45 et 46 DMR, et 2425 et 2695 MO respectivement. Ces altérations de méthylation sont enrichies dans des catégories de gènes pertinents pour le TSA, mais présentent des distributions génomiques et des voies fonctionnelles distinctes entre haplotypes parentaux. L'analyse des régions DMR d'origine parentale a identifié 443 régions ASM, dont 34 ASM différentiellement exprimés et 62 ASM aberrants, avec un enrichissement marqué dans le locus PWS/AS et les gènes associés au TSA. L'étude fournit des preuves d'un déséquilibre de méthylation dépendant de l'origine parentale dans la pathogenèse du TSA.
La mise en évidence de signatures de méthylation d'origine parentale pourrait ouvrir la voie à des biomarqueurs épigénétiques pour le diagnostic ou la stratification du TSA. Les résultats suggèrent que les mécanismes épigénétiques liés à l'empreinte parentale jouent un rôle dans la pathogenèse du TSA, ce qui pourrait influencer la recherche thérapeutique. L'enrichissement des ASM dans le locus PWS/AS souligne l'importance des régions d'empreinte dans les troubles neurodéveloppementaux, avec des implications pour le conseil génétique.
Élevé