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Cette étude utilise la modélisation d'équations structurelles génomiques sur des données de GWAS à grande échelle pour explorer les bases génétiques communes entre le trouble de la lecture (RD) et le trouble déficitaire de l'attention avec hyperactivité (TDAH). Un facteur génétique commun a été identifié, ainsi qu'un locus pléiotrope sur le chromosome 12 associé à l'expression de RHEBL1 et LMBR1L. Des corrélations génétiques significatives ont été observées avec six troubles psychiatriques et six traits comportementaux, suggérant un chevauchement génétique étendu.

Un facteur génétique commun entre le trouble de la lecture et le TDAH a été modélisé à l'aide de la modélisation d'équations structurelles génomiques. Un nouveau locus pléiotrope sur le chromosome 12 (rs7969091) a été identifié comme associé à la fois à la lecture et au TDAH. Les analyses transcriptomiques ont révélé des associations avec l'expression tissu-spécifique de RHEBL1 et LMBR1L dans ce locus. Des corrélations génétiques significatives ont été trouvées entre le facteur commun et six troubles psychiatriques (rg de -0,47 à 0,24) et six traits comportementaux (rg de 0,31 à 0,74).

Ces résultats soutiennent l'hypothèse d'une étiologie génétique partagée entre le trouble de la lecture et le TDAH, ce qui pourrait améliorer la compréhension de leur comorbidité fréquente. L'identification de variants génétiques communs pourrait à terme aider au dépistage précoce des enfants à risque pour ces deux troubles. Les corrélations avec d'autres troubles psychiatriques soulignent la nécessité d'une approche transdiagnostique en clinique.

L'étude repose sur des statistiques sommaires de GWAS et non sur des données individuelles, limitant la capacité à établir des relations causales. Les mesures de la lecture et du TDAH proviennent d'échantillons différents, ce qui peut introduire des biais hétérogènes. Les analyses transcriptomiques sont basées sur des données d'expression tissulaire et ne reflètent pas directement les mécanismes neuronaux spécifiques.

Élevé

Dans la cohorte COPSAC2010, 700 dyades mère-enfant ont été suivies pour évaluer l'effet des acides gras oméga-3 (DHA et EPA) maternels pendant la grossesse sur le risque de troubles neurodéveloppementaux à l'âge de 10 ans. Les concentrations sanguines maternelles en milieu de grossesse ont été mesurées, puis les mères ont été randomisées pour recevoir 2,4 g/j d'huile de poisson ou un placebo jusqu'à une semaine post-partum. Les résultats montrent qu'après ajustement sur les facteurs de confusion, il n'y a pas d'association significative entre les niveaux de DHA+EPA ou la supplémentation et le risque de TDAH ou de traits autistiques. Une analyse secondaire suggère un effet protecteur potentiel pour le sous-type inattentif du TDAH, mais non significatif après correction pour tests multiples.

Les concentrations maternelles de DHA+EPA en milieu de grossesse ne sont pas associées de manière indépendante au risque de TDAH ou de traits autistiques après ajustement sur les facteurs de confusion. La supplémentation en huile de poisson (2,4 g/j) en fin de grossesse n'a pas réduit significativement le risque de TDAH (OR 0,79, p=0,37) ou de TSA (OR 0,56, p=0,42) à l'âge de 10 ans. Une analyse secondaire a montré une réduction du risque de TDAH de type inattentif (OR 0,41, p=0,03) mais non significative après correction pour tests multiples (FDRp=0,12). Les analyses observationnelles non ajustées suggéraient un effet protecteur, mais disparaissent après prise en compte des facteurs de confusion, indiquant un possible biais de confusion.

Les données actuelles ne soutiennent pas une recommandation systématique de supplémentation en huile de poisson pendant la grossesse pour prévenir les troubles neurodéveloppementaux. L'effet potentiel sur le sous-type inattentif du TDAH mérite d'être exploré dans des études futures avec une puissance suffisante et des mesures spécifiques. Les cliniciens doivent informer les patientes que les preuves d'un bénéfice préventif sont insuffisantes, tout en soulignant l'importance d'un apport adéquat en acides gras essentiels pour la santé générale.

La taille de l'échantillon peut être insuffisante pour détecter des effets modestes sur des troubles rares comme le TSA. Les analyses secondaires multiples augmentent le risque d'erreur de type I, et les résultats significatifs non corrigés doivent être interprétés avec prudence. Les mesures observationnelles des concentrations sanguines de DHA+EPA sont sujettes à un biais de confusion résiduel malgré l'ajustement. L'essai a utilisé une dose unique (2,4 g/j) et une durée de supplémentation limitée à la fin de la grossesse, ce qui pourrait ne pas être optimal.

Élevé

Cette étude explore les mécanismes cellulaires et moléculaires des troubles neurodéveloppementaux sévères liés aux variants de SMPD4, qui provoquent microcéphalie et malformations corticales chez l'humain. En utilisant l'électroporation in utero et CRISPR-Cas9 chez le furet (modèle gyrencéphale), les auteurs montrent que la déficience en SMPD4 réduit la prolifération des progéniteurs, allonge la durée mitotique, diminue les progéniteurs intermédiaires, perturbe l'intégrité de l'enveloppe nucléaire, l'orientation du fuseau mitotique, la formation des cils primaires et la morphologie des progéniteurs. De plus, elle entraîne des défauts de migration neuronale. Le séquençage ARN unicellulaire révèle une dérégulation de gènes associés à la lissencéphalie, à la microcéphalie et à l'épilepsie. Cette étude établit le furet comme modèle pertinent pour ces pathologies et ouvre des perspectives translationnelles.

La déficience en SMPD4 induit une réduction de la prolifération des progéniteurs neuronaux et un allongement significatif de la durée mitotique. Le nombre de progéniteurs intermédiaires basaux est profondément réduit, entraînant une diminution de la production neuronale. L'intégrité de l'enveloppe nucléaire est compromise, l'orientation du fuseau mitotique est anormale et la formation des cils primaires est altérée. Les neurones corticaux présentent des défauts de migration sévères, avec un échec d'atteinte des couches appropriées. L'analyse transcriptomique unicellulaire montre une dérégulation de gènes liés à la lissencéphalie, à la microcéphalie, au retard de développement et à l'épilepsie. Le modèle furet reproduit les phénotypes humains, contrairement aux souris knockout, soulignant l'importance des modèles gyrencéphales.

Ces résultats fournissent des cibles moléculaires potentielles pour le développement de thérapies visant à atténuer les malformations corticales chez les patients porteurs de variants SMPD4. La compréhension des mécanismes de la neurogenèse indirecte et de la migration neuronale pourrait améliorer le conseil génétique et le diagnostic prénatal des anomalies corticales. Le modèle furet offre un outil translationnel pour tester des interventions pharmacologiques ou génétiques avant des essais cliniques.

L'étude est réalisée sur un modèle animal (furet) et nécessite une validation sur des tissus humains ou des organoïdes cérébraux. Les effets observés pourraient ne pas refléter l'ensemble de la variabilité génétique humaine (pénétrance, expressivité). Les mécanismes en aval de SMPD4 restent partiellement élucidés, notamment les voies de signalisation précises impliquées.

Élevé

Cette étude démontre que la perte de l'enoyl-CoA hydratase 1 (Echs1) dans les cellules souches/progénitrices neurales (NSPC) provoque une accumulation d'acides gras, une diminution de la prolifération et de la différenciation, et une augmentation de l'apoptose. Mécaniquement, le déficit en Echs1 augmente le crotonyl-CoA, induisant une crotonylation globale des histones (H3K9cr) sur les promoteurs de gènes comme Atf4, ce qui active le stress du réticulum endoplasmique (RE) et la surexpression de Fasn, créant une boucle auto-entretenue. L'inhibition de Fasn ou l'atténuation du stress du RE (via TUDCA ou inhibition d'Atf4) restaure la neurogenèse in vitro et améliore la survie in vivo. Ces résultats identifient un nouvel axe Echs1-H3K9cr-Atf4-Fasn liant métabolisme et neurogenèse, et suggèrent l'acide tauroursodésoxycholique (TUDCA) comme traitement potentiel pour le déficit en ECHS1D, une encéphalopathie rare du neurodéveloppement.

La perte d'Echs1 dans les NSPC entraîne une accumulation d'acides gras et altère la neurogenèse via un stress du RE. Le déficit en Echs1 augmente le crotonyl-CoA et induit une crotonylation des histones, enrichissant H3K9cr sur le promoteur d'Atf4. Atf4 active Fasn, ce qui exacerbe l'accumulation lipidique et le stress du RE dans une boucle de rétroaction positive. L'inhibition de Fasn ou l'atténuation du stress du RE (TUDCA ou inhibition d'Atf4) restaure la neurogenèse in vitro et in vivo. L'acide tauroursodésoxycholique (TUDCA) est proposé comme traitement potentiel pour l'ECHS1D.

Cette étude identifie une cible thérapeutique potentielle (TUDCA) pour l'ECHS1D, une encéphalopathie rare sévère. La compréhension de l'axe métabolisme-épigénétique-stress du RE pourrait éclairer d'autres troubles neurodéveloppementaux. Le repurpose du TUDCA, déjà approuvé dans d'autres indications, pourrait accélérer les essais cliniques pour l'ECHS1D. Les résultats soulignent l'importance du métabolisme lipidique et du stress du RE dans la neurogenèse précoce.

L'étude est réalisée sur des modèles murins et nécessite une validation chez l'humain. Le mécanisme est spécifique au déficit en Echs1 sa généralisabilité à d'autres pathologies reste à établir. L'efficacité et la sécurité du TUDCA dans l'ECHS1D n'ont pas encore été évaluées cliniquement. Les effets sur les stades ultérieurs du neurodéveloppement n'ont pas été explorés.

Élevé

Cette étude analyse l'architecture génétique partagée entre les tentatives de suicide (TS) et les idées suicidaires (IS) avec 13 traits psychiatriques, comportementaux et somatiques génétiquement corrélés, en utilisant des données de 15 études d'association pangénomique (N=46 350–975 353). Les méthodes LAVA et conjFDR ont identifié 16 loci à corrélation génétique locale significative, cartographiant 493 gènes uniques, et 798 gènes partagés via conjFDR. Après ajustement sur la dépression et le trouble de stress post-traumatique, des corrélations locus-trait persistent, notamment entre IS et TDAH. Les voies enrichies impliquent le transport ionique, la régulation transcriptionnelle, l'adhésion cellulaire, la neurogenèse, la transduction du signal, la régulation de la chromatine, les processus immunitaires et la sécrétion protéique. Les analyses stratifiées montrent que les TS sont enrichies en ensembles de gènes liés à la morphologie cérébrale, la cognition et le sommeil, tandis que les IS le sont pour le névrosisme, l'indice de masse corporelle et les traits gastro-intestinaux. Les deux partagent un enrichissement pour le métabolisme de la glycine, sérine et thréonine, le lupus érythémateux systémique, et la sénescence induite par dommages à l'ADN et stress télomérique. Ces résultats affinent l'architecture génétique du suicide et impliquent des mécanismes neurodéveloppementaux, immunitaires, métaboliques et de régulation de la chromatine.

16 loci de corrélation génétique locale significative ont été identifiés, cartographiant 493 gènes uniques. L'analyse conjFDR a révélé 798 gènes partagés entre les tentatives de suicide, les idées suicidaires et les traits corrélés. Après ajustement sur la dépression et le trouble de stress post-traumatique, des corrélations persistantes ont été observées, notamment entre les idées suicidaires et le TDAH. Les voies biologiques enrichies incluent le transport ionique, la régulation transcriptionnelle, l'adhésion cellulaire, la neurogenèse et les processus immunitaires. Les tentatives de suicide sont associées à des ensembles de gènes impliqués dans la morphologie cérébrale, la cognition et la régulation du sommeil. Les idées suicidaires sont associées à des gènes liés au névrosisme, à l'indice de masse corporelle et aux caractéristiques gastro-intestinales. Un enrichissement commun pour le métabolisme des acides aminés, le lupus érythémateux systémique et la sénescence cellulaire a été observé.

La compréhension des bases génétiques partagées entre suicide et d'autres traits pourrait améliorer l'évaluation du risque suicidaire notamment chez les patients avec TDAH, troubles de l'humeur ou obésité. L'implication de voies neurodéveloppementales et immunitaires suggère de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles pour la prévention du suicide. Les marqueurs génétiques identifiés pourraient à terme être intégrés dans des scores de risque polygénique pour stratifier les populations à haut risque. Le rôle des mécanismes liés à la chromatine et au stress télomérique ouvre des pistes pour des interventions précoces sur les facteurs environnementaux modulant l'expression génique.

Les données proviennent d'études d'association pangénomique avec des tailles d'échantillon variables, ce qui peut limiter la puissance statistique pour certaines analyses. Les résultats ne tiennent pas compte des variants rares ou des interactions gène-environnement non évaluées. La stratification populationnelle potentielle n'a pas été complètement contrôlée, malgré l'utilisation de données multi-ethniques. Les analyses de covariance locale ne permettent pas d'établir la causalité entre les traits corrélés. Les fonctions des gènes cartographiés nécessitent une validation fonctionnelle in vitro ou in vivo.

Élevé

Cette étude a analysé les données de séquençage d'exomes de 257 trios de patients atteints de dystonie afin d'identifier des variants de novo dans des gènes fortement contraints sur le plan mutationnel. Des variants faux-sens et perte de fonction de novo ont été trouvés dans 11,7% des cas. Sept patients non apparentés présentant des troubles du mouvement et neurodéveloppementaux portaient des variants faux-sens de novo délétères distincts dans KLC1, codant une sous-unité de la kinésine-1. Ces variants se groupent dans le domaine TPR de liaison aux adaptateurs de cargaison, et trois variants ciblent le même acide aminé, associés à un phénotype dystonique-spastique à début infantile. Des études fonctionnelles ont montré des changements de stabilité de KLC1 et/ou une altération de la liaison à des interacteurs comme JIP3, précédemment liés à la dystonie. Ces résultats suggèrent l'existence d'une kinésinopathie liée à KLC1 avec un recouvrement phénotypique avec d'autres maladies liées à des défauts mutationnels de ses interacteurs.

11,7% des cas de dystonie (30/257 trios) présentent des variants de novo dans des gènes contraints, sans implication antérieure dans des maladies autosomiques dominantes ou liées à l'X. Sept patients non apparentés avec troubles du mouvement et neurodéveloppementaux partagent des variants faux-sens de novo dans KLC1, clusterisés dans le domaine TPR. Trois variants affectent le même résidu d'acide aminé et sont associés à un phénotype dystonique-spastique sévère à début infantile. Les études fonctionnelles révèlent une altération de la stabilité de KLC1 et/ou de la liaison à des partenaires comme JIP3, un interacteur déjà impliqué dans la dystonie. Ce travail établit une nouvelle kinésinopathie liée à KLC1, avec un spectre clinique chevauchant d'autres maladies neurodéveloppementales et motrices.

Le séquençage en trio devrait être considéré dans l'évaluation génétique des dystonies, en particulier chez l'enfant avec atteinte neurodéveloppementale. Les variants de KLC1 doivent être recherchés chez les patients présentant une dystonie-spasticité infantile d'origine inconnue. La reconnaissance de cette kinésinopathie pourrait guider le conseil génétique et le suivi des patients, avec une possible stratification des essais thérapeutiques. Les données issues de cette étude (compendium des variants de novo) constituent une ressource pour de futures découvertes de gènes de dystonie.

L'échantillon de patients porteurs de variants KLC1 est limité à sept individus, nécessitant une confirmation dans des cohortes plus larges. Tous les variants fonctionnellement testés ne l'ont pas été dans les mêmes conditions, et certains variants n'ont pas été testés. Les études fonctionnelles ont été réalisées in vitro et peuvent ne pas refléter pleinement la pathogénie in vivo. La pénétrance et l'expressivité des variants KLC1 restent à déterminer dans des populations non apparentées.

Élevé

Cette étude examine les bases génétiques partagées entre la schizophrénie résistante au traitement (TRS) et l'initiation au tabagisme. En utilisant des données pangénomiques et des méthodes statistiques avancées, les auteurs identifient une corrélation génétique positive significative et quatre nouveaux loci communs. L'analyse de randomisation mendélienne suggère un effet causal de la TRS sur le tabagisme. Les résultats mettent en évidence le rôle potentiel des récepteurs alpha-1-adrénergiques dans la TRS, ouvrant des perspectives thérapeutiques.

Corrélation génétique significative entre TRS et initiation au tabagisme (rg = 0,47, p = 0,0002). Quatre nouveaux loci partagés identifiés via l'approche cond/conjFDR. La randomisation mendélienne indique un effet causal probable de la TRS sur l'initiation au tabagisme. Les gènes partagés enrichis pour les récepteurs alpha-1-adrénergiques, cibles potentielles de traitement. L'intégration du chevauchement génétique améliore la prédiction polygénique de la TRS.

Les variants génétiques liés au tabagisme pourraient aider à identifier précocement les patients à risque de TRS. Les récepteurs alpha-1-adrénergiques représentent une cible médicamenteuse potentielle pour la TRS. La clozapine pourrait être plus efficace chez les patients avec certaines variations génétiques partagées. L'arrêt du tabac pourrait moduler le risque génétique de développer une TRS.

Données issues principalement de populations européennes, limitant la généralisabilité. La causalité inférée par randomisation mendélienne peut être biaisée par pléiotropie. Définition de la TRS variable selon les cohortes, pouvant entraîner une hétérogénéité. Taille d'échantillon modeste pour la découverte de nouveaux loci génétiques.

Élevé